Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLN8Q9UBY8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms