Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CTNNAL1Q9UBT7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
CTNNAL1Q9UBT7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTNNAL1Q9UBT7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTNNAL1Q9UBT7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTNNAL1Q9UBT7 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CTNNAL1Q9UBT7 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNAL1Q9UBT7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNAL1Q9UBT7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNAL1Q9UBT7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNAL1Q9UBT7 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNAL1Q9UBT7 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNAL1Q9UBT7 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNAL1Q9UBT7 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNAL1Q9UBT7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CTNNAL1Q9UBT7 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms