Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
DKK4Q9UBT3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
DKK4Q9UBT3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms