Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX3Q9UBR4 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX3Q9UBR4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX3Q9UBR4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX3Q9UBR4 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX3Q9UBR4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX3Q9UBR4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX3Q9UBR4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX3Q9UBR4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX3Q9UBR4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
LHX3Q9UBR4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LHX3Q9UBR4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
LHX3Q9UBR4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LHX3Q9UBR4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms