Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS29Q9UBQ0 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms