Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPASTQ9UBP0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms