Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRP2BPQ9P2M1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms