Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.13
CC2D2AQ9P2K1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CC2D2AQ9P2K1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms