Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
KLHL9Q9P2J3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
KLHL9Q9P2J3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms