Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZV6

MSRB1, Methionine-R-sulfoxide reductase B1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRB1Q9NZV6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
MSRB1Q9NZV6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms