Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C9orf78Q9NZ63 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms