Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ZDHHC3Q9NYG2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms