Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SLCO1C1Q9NYB5 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms