Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FANCLQ9NW38 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms