Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP7BPQ9NSQ0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP7BPQ9NSQ0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP7BPQ9NSQ0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP7BPQ9NSQ0 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP7BPQ9NSQ0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP7BPQ9NSQ0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP7BPQ9NSQ0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP7BPQ9NSQ0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP7BPQ9NSQ0 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP7BPQ9NSQ0 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP7BPQ9NSQ0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP7BPQ9NSQ0 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP7BPQ9NSQ0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP7BPQ9NSQ0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP7BPQ9NSQ0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP7BPQ9NSQ0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRP7BPQ9NSQ0 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP7BPQ9NSQ0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP7BPQ9NSQ0 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP7BPQ9NSQ0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP7BPQ9NSQ0 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP7BPQ9NSQ0 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RRP7BPQ9NSQ0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms