Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNTG1Q9NSN8 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms