Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS23

RASSF1, Ras association domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF1Q9NS23 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RASSF1Q9NS23 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASSF1Q9NS23 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms