Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HELLSQ9NRZ9 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HELLSQ9NRZ9 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms