Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TULP4Q9NRJ4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TULP4Q9NRJ4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms