Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DUOX1Q9NRD9 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms