Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQR4

NIT2, Omega-amidase NIT2, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIT2Q9NQR4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
NIT2Q9NQR4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
NIT2Q9NQR4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms