Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HMG20AQ9NP66 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms