Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCG8

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC22Q9HCG8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CWC22Q9HCG8 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms