Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CENPJQ9HC77 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CENPJQ9HC77 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms