Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9D4

ZNF408, Zinc finger protein 408, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF408Q9H9D4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF408Q9H9D4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF408Q9H9D4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms