Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4L4

SENP3, Sentrin-specific protease 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP3Q9H4L4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 ETFRF1-201ENST00000381356 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 ANAPC10-202ENST00000451299 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SENP3Q9H4L4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AP001793.2-201ENST00000580267 780 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AC104162.1-204ENST00000443346 708 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AC114495.2-201ENST00000452686 437 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AP003122.2-201ENST00000527332 486 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 ACP1-203ENST00000405233 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 CNIH1-203ENST00000553660 785 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 LINC01571-201ENST00000563603 811 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SENP3Q9H4L4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms