Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CLSTN2Q9H4D0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms