Protein–RNA interactions for Protein: Q9H223

EHD4, EH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4Q9H223 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EHD4Q9H223 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EHD4Q9H223 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms