Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDGFDQ9GZP0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFDQ9GZP0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms