Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
BCL11BQ9C0K0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BCL11BQ9C0K0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms