Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CEP44Q9C0F1 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CEP44Q9C0F1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms