Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000280.1-201ENST00000624800 832 ntBASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 SUGT1P3-205ENST00000633814 572 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010082.1-201ENST00000411797 546 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 BOLL-205ENST00000433157 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 GYG2-AS1-201ENST00000445107 515 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTP4A2-201ENST00000457805 1032 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073611.1-201ENST00000550263 647 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC8.8□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLCN5-205ENST00000482218 449 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
KRTAP9-3Q9BYQ3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms