Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HDAC8Q9BY41 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms