Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HIRIP3Q9BW71 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HIRIP3Q9BW71 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms