Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KATNB1Q9BVA0 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KATNB1Q9BVA0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms