Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3CQ99985 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3CQ99985 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3CQ99985 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3CQ99985 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3CQ99985 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3CQ99985 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3CQ99985 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3CQ99985 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3CQ99985 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3CQ99985 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3CQ99985 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3CQ99985 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3CQ99985 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3CQ99985 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3CQ99985 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SEMA3CQ99985 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEMA3CQ99985 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms