Protein–RNA interactions for Protein: Q99942

RNF5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF5Q99942 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RNF5Q99942 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms