Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 AC090971.1-201ENST00000559302 510 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PHF12Q96QT6 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms