Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
NSMCE2Q96MF7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
NSMCE2Q96MF7 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms