Protein–RNA interactions for Protein: Q96M27

PRRC1, Protein PRRC1, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC1Q96M27 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PRRC1Q96M27 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PRRC1Q96M27 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms