Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX22Q96L94 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms