Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGBD1Q96JS3 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PGBD1Q96JS3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms