Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC136Q96JN2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC136Q96JN2 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms