Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 AC062031.1-201ENST00000414967 747 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 AC092964.1-201ENST00000623304 1399 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 MAPK10-379ENST00000642013 1385 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 ZCCHC6-202ENST00000375947 611 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 DEFT1P-201ENST00000453425 496 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MS4A3Q96HJ5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 LINC01821-202ENST00000438505 882 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MS4A3Q96HJ5 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms