Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DNAJA3Q96EY1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
DNAJA3Q96EY1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms