Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
EXOSC8Q96B26 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms