Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC47Q96A33 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC47Q96A33 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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