Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
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UBE2E3Q969T4 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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UBE2E3Q969T4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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UBE2E3Q969T4 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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UBE2E3Q969T4 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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UBE2E3Q969T4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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UBE2E3Q969T4 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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UBE2E3Q969T4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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UBE2E3Q969T4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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UBE2E3Q969T4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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UBE2E3Q969T4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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UBE2E3Q969T4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
UBE2E3Q969T4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms