Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BRF1Q92994 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms