Protein–RNA interactions for Protein: Q92922

SMARCC1, SWI/SNF complex subunit SMARCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCC1Q92922 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMARCC1Q92922 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMARCC1Q92922 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms